В основе собрания — произведения отечественных маринистов ХХ — XXI вв. (А.М. Балобаев, Е.М. Скитальцев, С.В. Пен, А.П. Красильщиков, Е.В. Богданов, Е.И. Дацко, Ф. Ф. Конюхов и др.), а также  работы западноевропейских художников XIX — ХХ вв., творивших в основном на берегах Балтийского моря (Э.Бишоф-Кульм, О. Йернберг, Л. Даннель и др.). Калининградское искусство второй половины ХХ в. — начала XXI в. представлено коллекциями произведений живописи М.Г. Пясковского, В.М. Михайловского, И.Н. Шипилина и др. За долгую творческую жизнь художникам удалось создать подлинный портрет края, ставшего их малой родиной.

В 2015 г. художник-маринист А.П. Красильщиков подарил музею коллекцию живописных работ, большая часть которых была создана во время двух кругосветных пленэров на УПС «Крузенштерн». Во время этих плаваний художнику довелось дважды обогнуть земной шар, неоднократно пересечь экватор, побывать практически на всех континентах. Итогом творческого путешествия стали более двухсот работ, на которых запечатлены не только живописные достопримечательности, яркие моменты путешествий и главные участники, но и эмоциональная сторона того, что происходило на борту корабля.

В 2018 г. художником-маринистом В.М. Михайловским были подарены музею более 50 произведений. Владимир Михайлович создал множество художественных работ, на которых изображен труд простых рыбаков, водные порты, экзотические морские побережья, яхты. Большое влияние на творчество художника оказала его командировка на судне промыслового флота в северную Атлантику. Во время этой поездки он создал множество этюдов и запасся творческими идеями на долгие годы.