Библиотека располагает ценнейшими материалами по следующим направлениям:

• Науки о Земле, включая океанологию, геологию, гляциологию и экологию;
• География, географические открытия, страноведение и краеведение
• Биология, зоология и ихтиология
• История флота и судостроения
• Военно-морской флот и история России
• Изобразительное искусство представлено альбомами русских и зарубежных изданий.
• Коллекции художественной литературы морской тематики («Морской роман», «Здравствуй, море!», «Библиотека приключений и фантастики».)

Особое внимание уделяется собранию коллекций книг, изданных Музеем Мирового океана, Российским географическим обществом (РГО), а также издательствами «Паулсен» и «Географгиз».

Музей бережно хранит мемориальные библиотеки и труды учёных.

Библиотека служит важным ресурсом для изучения и популяризации морского наследия нашей страны, способствуя сохранению исторической памяти и развитию научного знания.